我院李向涛教授以第一作者发表论文Deep Embedded Clustering with Multiple Objectives on scRNA-seq Data近日被Briefings in Bioinformatics杂志接收。Briefings in Bioinformatic 是Oxford Academic出版社旗下的生物信息学和计算生物学领域的顶级杂志，中科院一区TOP期刊，SCI IF（2020）=8.99。
文章提出一种多目标进化自动神经架构搜索方法设计深度嵌入聚类的模型架构。算法将高维稀疏的scRNA-seq数据特性及去噪自动编码器融合至深度嵌入聚类中，并提出迁移模型，变异模型及几种多目标优化目标函数引导算法演化深度嵌入聚类的模型架构，最终提高细胞类型识别精度。并针对高维稀疏scRNA-seq数据进行标记基因识别、基因本体富集和KEGG分析，揭示细胞类型识别和表征机制的新见解。本工作是结合深度学习和生物信息学等多学科交叉的优势共同完成。
