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2020级硕士研究生侯子龙同学论文被生物信息学和计算生物学领域顶级期刊接收

发布时间:2021-07-06点击:

我院李向涛教授指导的2020级硕士研究生侯子龙同学的论文iDeepSubMito: Identification of protein sub-mitochondrial localization with deep learning近日被Briefings in Bioinformatics杂志接收。Briefings in Bioinformatic Oxford Academic出版社旗下的生物信息学和计算生物学领域的顶级杂志,中科院一区TOP期刊SCI IF2021=11.622

文章提出通过动态自然语言模型ELMo编码蛋白质序列,并搭建了深度学习模型在亚线粒体蛋白定位的分类任务上测试其性能。文章同时对比了多种不同的特征提取方式,并和众多的机器学习方法作了比较。最后通过广泛性分析、Motif分析、可解释性分析等实验进一步揭示了该模型的有效性。