Advanced Science是美国于2014年创办的综合性期刊，致力于跨学科合作研究，涉及材料科学、物理学、化学、医学、生命科学和工程学等多个学科的基础或者应用研究。
论文题目：
Accurate Spatial Heterogeneity Dissection and Gene Regulation Interpretation for Spatial Transcriptomics using Dual Graph Contrastive Learning
论文作者：于卓含
指导教师：李向涛
收录期刊：Advanced Science
论文概述：
空间转录组学的最新进展使得同时保存高通量基因表达谱和空间背景成为可能，从而能够高分辨率地探索组织中不同的区域特征。为了有效地理解组织微环境中的潜在生物学机制，本文提出了一种对偶图对比学习方法stDCL，用于识别空间域并解释空间转录组学数据中的基因调控。stDCL 通过图嵌入自动编码器自适应地结合基因表达数据和空间信息，从而在潜在嵌入表示中保留关键信息。通过使用复杂的皮质数据集对stDCL与其他最先进的聚类方法进行比较，证明了其在识别空间域方面的卓越准确性和有效性。stDCL生成的插补矩阵的分析揭示了它重建空间层次结构和细化差异表达评估的能力。此外，stDCL具有在基因调控的可解释性、高分辨率的空间异质性和胚胎发育模式方面的多功能性，并且能够成功注释阿尔茨海默病中与疾病相关的星形胶质细胞亚型，揭示多种相关途径和调节机制。
